PrimeMate: Generador de cebadores rápido y eficiente para Ensembl
PrimeMate es un complemento de Chrome desarrollado por PrimeMate que sirve como generador de cebadores para Ensembl. Permite a los usuarios generar cientos de pares de cebadores con parámetros personalizables y ordenarlos según sus preferencias.
Con PrimeMate, los usuarios pueden trabajar fácilmente con la base de datos genómica de Ensembl simplemente navegando hasta la secuencia deseada y haciendo clic en "buscar cebadores". El complemento ofrece una variedad de opciones personalizables como longitud óptima del producto, temperatura de fusión, contenido de G/C y umbral de dimerización/horquilla.
Una de las características destacadas de PrimeMate es su capacidad para mostrar información detallada para cada producto, incluyendo longitud, temperatura de fusión y ubicación del exón. Los usuarios también pueden ordenar los resultados generados según sus criterios preferidos ajustando el peso de ordenamiento para cada variable.
PrimeMate va más allá al filtrar automáticamente productos indeseables, como cebadores que se dimerizan entre sí o aquellos con ubicaciones subóptimas en la secuencia. También proporciona la opción de guardar secuencias seleccionadas por el usuario en una fila de "Favoritos" para un acceso fácil y permite compartir sin problemas copiando las secuencias al portapapeles.
En general, PrimeMate es una herramienta potente y eficiente para la generación de cebadores en Ensembl, que ofrece una interfaz fácil de usar y una amplia gama de opciones personalizables.